以涉税信息的采集、分析、利用为主线，基于数据仓库技术和税源分析模型的应用，通过对税源分析和税收疑点的处理，实现对税源的全过程管理，促进了税源向税收的转化。
通过各政府部门信息的汇集，有助于改善以往信息不对称的情况；通过对税源数据的分析，可直接或间接地了解经济整体运行状况,如税源的增减、税源的结构、税源的变化趋势、税源的区域分布等，反映经济运行的重要信息。加强税源管理，可使税源管理部门掌握税源变化状况，分析税源的地区分布、行业分布、税种分布、纳税人分布，进而有针对性地实施管理，堵塞税收流失的源头，治理税收流失的问题。
综合治税系统的应用过程大体分为信息的采集、分析和利用三个层面。
在信息采集层建设信息交换平台。通过信息交换平台采集政府部门的涉税原始数据。数据采集相关技术方式很多，有在线填报、中间文件交换、接口开发、数据库直连等等。
信息交换平台采集来的各种原始数据，通过ETL工具的抽取、清洗/转换、加载到数据仓库中，进入到信息分析层。
信息分析层最重要的应用是在数据仓库的基础上建立 综合治税 模块、税源监控和决策支持模块和收入分析模块。
通过综合治税模块、税源监控模和决策支持块以及收入分析模块对原始数据的分析和挖掘，最终形成分析数据和报告库。以信息比对为例，原本看似毫不相关的原始的涉税数据，通过大数据应用，即会发现跑冒滴漏等问题。